Na správu příkazů je možné se v aplikaci prokliknut na dvou místech. Hlavní stránka aplikace Cubee nabízí přehled příkazů, které v blízké době proběhnou, nebo který právě nyní probíhá.Dalším místem, které ukrývá přehled o příkazech je levý horní roh sekce Nástěnka. Tato karta zároveň zobrazuje počet příkazů, které jsou dopředu naplánovány.
Přehled příkazů zobrazuje časové rozložení jednotlivých příkazů v grafu. Graf zároveň ukazuje příkazy v kontextu nákupních a prodejních cen.Co jednotlivé příkazy znamenají, se lze dočíst v článku Typy příkazů
Tato část aplikace umožňuje i vlastnoruční přepsání optimalizačního modelu Cubee. Jak se provadí změna příkazů zvolených algoritmem, a kdy je výhodná se lze dočíst v článku Přidání vlastního příkaz.